Até o presente momento, foram produzidos 8 livros e 130 trabalhos científicos e 55 Relatórios resultantes de trabalhos realizados (Consultorias e Pesquisas).

O IIE - Instituto Internacional de Ecologia publica revistas científicas, trabalhos científicos, livros e manuais em inglês, português e espanhol.

- IIE está traduzindo para o português todos os livros da série do ILEC: Diretrizes para o gerenciamento de lagos.

Revista Científica: BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY "The International Journal on Neotropical Biology"
- Brazilian Journal of Biology - BJB Antigamente esta publicação era da Academia Brasileira de Ciências, hoje, está sob a responsabilidade do IIE e da Associação da Revista Brasileira de Biologia - ARBB. São publicados quatro números cada ano. A revista é indexada em vários índices internacionais e publica artigos na área: Biologia Neotropical. Isto inclui, Liminologia, Ecologia Terrestre, Biologia Marinha, Zoologia, Botânica e Biologia Geral. A revista está à disposição de forma eletrônica no programa SciELO da FAPESP. A revista está sendo considerada pelo ISI para indexação. A Associação da Revista Brasileira de Biologia ARBB, apóia o BJB que é a revista internacional da biota neotropical.
- Além destas publicações, o IIE publica, em revistas especializadas trabalhos científicos originais, revisões e notas técnicas.